Die Janusz Korczak-Schule kooperiert seit vielen Jahren mit der Georg-Büchner-Schule, Dreieich und der Friedrich-Fröbel-Schule, Neu-Isenburg. Beides sind Schulen mit dem Förderschwerpunkt Lernen. Zielgruppe der Kooperation sind Schülerinnen und Schüler, die sich im "Grenzbereich" der Schule Lernen und geistige Entwicklung bewegen. Stammschule ist bei diesen Schülern die Janusz-Korczak-schule; der Förderort ist die jeweilige Schule mit dem Fördershwerpunkt Lernen. Die pädagogische und organisatorische Umsetzung des Konzeptes ist in einer Kooperationsvereinbarung geregelt.